libjvm.so: невозможно открыть общий объектный файл: нет такого файла или каталога
Попытка установить пакет rJava на R, на моем Ubuntu 14.10, используя этот код
if (!require(rJava)) install.packages('rJava')
получил несколько ошибок, связанных с Java, в том числе проблемы с jni, после переустановки jdk и попытался снова запустить тот же код, получил эту ошибку
Error : .onLoad failed in loadNamespace() for 'rJava', details:
call: dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...)
error: unable to load shared object '/usr/local/lib/R/site-library/rJava/libs/rJava.so':
libjvm.so: cannot open shared object file: No such file or directory
Error: loading failed
Execution halted
ERROR: loading failed
* removing ‘/usr/local/lib/R/site-library/rJava’
Warning in install.packages :
installation of package ‘rJava’ had non-zero exit status
The downloaded source packages are in
‘/tmp/RtmpfFjrp0/downloaded_packages’
Warning message:
In library(package, lib.loc = lib.loc, character.only = TRUE, logical.return = TRUE, :
there is no package called ‘rJava’
искал решения, чтобы найти практически всех, кто предлагает (для x64) выполнить эти команды
export LD_LIBRARY_PATH=/usr/lib/jvm/java-8-oracle/lib/amd64:/usr/lib/jvm/java-8-oracle/jre/lib/amd64/server
sudo R CMD javareconf
но это не сработало, я могу еще что-нибудь сделать? Я предоставлю любую необходимую информацию, и поиск libjvm.so на всей машине привел к этому
/usr/lib/jvm/java-8-oracle/jre/lib/amd64/server/libjvm.so
/usr/lib/jvm/jdk1.8.25/jre/lib/amd64/server/libjvm.so
/usr/local/java/jre1.7.0_75/lib/amd64/server/libjvm.so
3 ответа
Выполнение следующего должно решить вашу проблему:
$ export LD_LIBRARY_PATH=/usr/lib/jvm/java-8-oracle/jre/lib/amd64/server
$ sudo R CMD javareconf
Иногда это нужно R CMD javareconf -e
Шаги :
Найдите свое местоположение R Будет храниться в
rsession-ld-library-path
вrserver.conf
файл. Или просто делаяwhich R
, Местоположение обычно/usr/lib64/R/lib
или же/usr/lib64/microsoft-r/3.3/lib64/R/lib
Найти
libjvm.so
файл, который обычно находится вusr/lib/jvm/java-8-openjdk-amd64/jre/lib/amd64/server
путь в зависимости от того, какой JRE вы используете. Проверьтеecho $JAVA_HOME
,Создайте символическую ссылку, используя
ln -s
sudo ln -s /usr/lib/jvm/java-8-openjdk-amd64/jre/lib/amd64/server/libjvm.so /usr/lib64/microsoft-r/3.3/lib64/R/lib/libjvm.so
Перезагрузите R сервер