Сделать приложения, не забывать настройки

Я использую Ubuntu с i3 в качестве моего оконного менеджера. По некоторым причинам некоторые из моих приложений забывают изменения, которые я вносю в их настройки, если я не запускаю приложения от имени пользователя root. Например, если я пытаюсь добавить ярлык в папку Dropbox на левой панели ярлыков в файловом менеджере Thunar, Thunar забывает ярлык после его закрытия. Если я запускаю Eye of Gnome (EOG), я даже не могу включать и выключать панель построения в "свойствах изображения", если не запускаю ее как root. Я подозреваю, что это потому, что файлы конфигурации приложений не принадлежат моему пользователю, но я не уверен. И если это так, я не знаю, как это изменить. Если я, например, типа ls -al ~/.config/Thunar в терминал я получаю следующее сообщение:

ls: cannot open directory '/home/USERNAME/.config/Thunar': Permission denied