Обновление Ubuntu переписало (почти) весь домашний каталог

Извините за неописуемый заголовок и отсутствие технических деталей, но я абсолютно озадачен тем, что происходит:

Сегодня на моей машине было установлено обновление для GNOME Ubuntu 18.04. Обновление, однако, не заканчивалось обычным диалогом о перезапуске системы, а отображало диалог, который вы получаете при первом запуске Ubuntu (выбор раскладки клавиатуры, включение / отключение служб определения местоположения и т. Д.), Затем система зависала.

Я перезапустил машину, и теперь почти все файлы в моем домашнем каталоге (и любом другом пользователе) исчезли. Файлы, которые все еще есть, находятся в одном / git-хранилище внутри ~/git (их было более 40) и в частях miniconda внутри ~/miniconda3/lib. Я действительно не вижу образец там.

Я абсолютно не знаю, с чего начать или какую дополнительную информацию я могу предоставить.

Изменить: я использовал TestDisk для просмотра своих томов и обнаружил, что файлы по-прежнему присутствуют в /dev/dm-0 (или /dev/mapper/ubuntu- gnome - vg-root), но не в /dev/sda. Есть ли способ восстановить сопоставление?