Сценарий установки R & RStudio для Ubuntu 18.04: пакеты TDD
Я сделал установку для R и R Studio для Ubuntu 18.04. Намерение состоит в том, чтобы иметь работающую установку R Studio с типичными пакетами, используемыми в типичной обработке данных. Сценарий выглядит следующим образом:
# Install R
sudo apt update
sudo apt install gdebi libxml2-dev libssl-dev libcurl4-openssl-dev libopenblas-dev r-base r-base-dev
# Install RStudio
cd ~/Downloads
wget https://download1.rstudio.org/rstudio-xenial-1.1.447-amd64.deb
sudo gdebi rstudio-xenial-1.1.447-amd64.deb
printf '\nexport QT_STYLE_OVERRIDE=gtk\n' | sudo tee -a ~/.profile
# Install common packages
R --vanilla << EOF
install.packages(c("tidyverse","data.table","dtplyr","devtools","roxygen2","bit64","readr"), repos = "https://cran.rstudio.com/")
q()
EOF
# Install TDD packages
install.packages("testthis")
# Export to HTML/Excel
R --vanilla << EOF
install.packages(c("htmlTable","openxlsx"), repos = "https://cran.rstudio.com/")
q()
EOF
# Blog tools
R --vanilla << EOF
install.packages(c("knitr","rmarkdown"), repos='http://cran.us.r-project.org')
q()
EOF
sudo apt install python-pip
sudo apt install python3-pip
sudo -H pip install markdown rpy2==2.7.1 pelican==3.7.1
sudo -H pip3 install markdown rpy2==2.9.3 pelican==3.7.1
# PDF extraction tools
sudo apt install libpoppler-cpp-dev default-jre default-jdk r-cran-rjava
sudo R CMD javareconf
R --vanilla << EOF
library(devtools)
install.packages("pdftools", repos = "https://cran.rstudio.com/")
install_github("ropensci/tabulizer")
q()
EOF
# TTF/OTF fonts usage
sudo apt install libfreetype6-dev
R --vanilla << EOF
install.packages("showtext", repos = "https://cran.rstudio.com/")
q()
EOF
# Cairo for graphic devices
sudo apt install libgtk2.0-dev libxt-dev libcairo2-dev
R --vanilla << EOF
install.packages("Cairo", repos = "https://cran.rstudio.com/")
q()
EOF
Сценарий также доступен здесь. Он основан на похожем скрипте для 17.10, доступном здесь. Скрипт и полученная RStudio-установка были протестированы на Ubuntu Bungie 18.04 4.15.0-20-generic. Кажется, все работает идеально (пока...).
Я добавил все пакеты, которые я обычно использую для общей обработки данных. Тем не менее, я новичок в TDD в R, и единственный пакет, который я до сих пор использовал для R-TDD, это testthat 3. Этот пакет меня охватил, но есть ли другие связанные с TDD пакеты, которые должны быть добавлены в скрипт вроде этого?