Как узнать количество уникальных заголовков в файле fasta?

Я просматриваю пару файлов fasta и хочу выяснить, как найти уникальные заголовки каждого файла. Я попытался использовать следующую команду, но она не сработала.

uniq -u reference.fasta >> reference_uniq.fasta

Я хочу перенаправить уникальные заголовки в отдельный файл в целом.