Привет, я успешно установил deseq2 и R через Conda в Ubuntu, но когда я использовал команду, я получил ошибки
Кот countts.txt | Rscript deseq1.r 3x3 > results_deseq1.txt Загрузка требуемого пакета: BiocGenerics Загрузка требуемого пакета: параллельный
Прилагаемый пакет: "BiocGenerics"
Следующие объекты маскируются из "пакета: параллель":
clusterApply, clusterApplyLB, clusterCall, clusterEvalQ,
clusterExport, clusterMap, parApply, parCapply, parLapply,
parLapplyLB, parRapply, parSapply, parSapplyLB
Следующие объекты маскируются из 'package: stats':
IQR, mad, sd, var, xtabs
Следующие объекты маскируются из 'package: base':
Filter, Find, Map, Position, Reduce, anyDuplicated, append,
as.data.frame, basename, cbind, colMeans, colSums, colnames,
dirname, do.call, duplicated, eval, evalq, get, grep, grepl,
intersect, is.unsorted, lapply, lengths, mapply, match, mget,
order, paste, pmax, pmax.int, pmin, pmin.int, rank, rbind,
rowMeans, rowSums, rownames, sapply, setdiff, sort, table, tapply,
union, unique, unsplit, which, which.max, which.min
Загрузка необходимого пакета: Biobase
Добро пожаловать в Биокондуктор
Vignettes contain introductory material; view with
'browseVignettes()'. To cite Bioconductor, see
'citation("Biobase")', and for packages 'citation("pkgname")'.
Загрузка необходимого пакета: locfit locfit 1.5-9.1 2013-03-22 Загрузка необходимого пакета: решетка Добро пожаловать в 'DESeq'. Для повышения производительности, удобства использования и функциональности рассмотрите возможность перехода на "DESeq2". Ошибка в цикле (x): нечисловой аргумент математической функции Вызовы: apply -> FUN Выполнение остановлено (bioinfo)