Как заставить разобрать командную строку?

Во-первых, файл с .c расширение скорее всего является исходным C-файлом. Нет смысла разбирать его. Чтобы убедиться, что файл на самом деле является программой, используйте file команда:

$ file test.c
test.c: ASCII text
$ file /bin/bash
/bin/bash: ELF 64-bit LSB  executable, x86-64, version 1 (SYSV), dynamically linked
(uses shared libs), for GNU/Linux 2.6.24,
BuildID[sha1]=54967822da027467f21e65a1eac7576dec7dd821, stripped

Что касается разборки, используйте objdump вместо. Из справочной страницы:

NAME
       objdump - display information from object files.

SYNOPSIS
       objdump [...]
               [-d|--disassemble]

Итак, чтобы разобрать, скажем, файл с именем a.outиспользовать

$ objdump -d a.out 

a.out:     file format elf64-x86-64


Disassembly of section .init:

00000000004003a8 <_init>:
  4003a8:   48 83 ec 08             sub    $0x8,%rsp
  4003ac:   48 8b 05 45 0c 20 00    mov    0x200c45(%rip),%rax        # 600ff8 <_DYNAMIC+0x1d0>
  4003b3:   48 85 c0                test   %rax,%rax
  4003b6:   74 05                   je     4003bd <_init+0x15>
  4003b8:   e8 33 00 00 00          callq  4003f0 <__gmon_start__@plt>
  4003bd:   48 83 c4 08             add    $0x8,%rsp
  4003c1:   c3                      retq   
[...] and so on...

Я думаю, что вы хотите, это функция gdb, отладчик gnu, который имеет команду дизассемблирования. Во-первых, вы должны скомпилировать test.c с включенными флагами отладки, например:gcc -Wall -g -o test test.c

Или что-то вдоль этих линий. Затем вы должны запустить приложение с gdb в качестве аргумента:

gdb test

как только вы попали в GDB, вы можете использовать команду disassemble следующим образом:

(gdb) break main
(gdb) disassemble main

Возьмем эту тривиальную программу с именем test.cpp:

#include <iostream>
using namespace std;
int main ()
{
    int a=0;
    for (int b = 0; b < 11; b++){
        a=b+2;
        cout << a << "\n\t";
    }
cout << "Hello World \n";     
return 0;
}

сейчас я скомпилирую его с флагами отладки:

g++ -Wall -g test.cpp -o test

Тогда вы говорите, но j0h, это вопрос C... на который я говорю, GDB не волнует, какой язык вы используете. Вы можете отлаживать и дизассемблировать c, C++, ассемблер, fortran и множество других вещей, просто скомпилируйте с опцией -g, вот что важно.

как только мы загрузим программу в gdb и сломаем main, мы можем запустить disassemble:

Breakpoint 1 at 0x4007da
(gdb) disassemble main
Dump of assembler code for function main:
   0x00000000004007d6 <+0>: push   %rbp
   0x00000000004007d7 <+1>: mov    %rsp,%rbp
   0x00000000004007da <+4>: sub    $0x10,%rsp
   0x00000000004007de <+8>: movl   $0x0,-0x4(%rbp)
   0x00000000004007e5 <+15>:    movl   $0x0,-0x8(%rbp)
   0x00000000004007ec <+22>:    jmp    0x400817 <main+65>
   0x00000000004007ee <+24>:    mov    -0x8(%rbp),%eax
   0x00000000004007f1 <+27>:    add    $0x2,%eax
   0x00000000004007f4 <+30>:    mov    %eax,-0x4(%rbp)
   0x00000000004007f7 <+33>:    mov    -0x4(%rbp),%eax
   0x00000000004007fa <+36>:    mov    %eax,%esi
   0x00000000004007fc <+38>:    mov    $0x601080,%edi
   0x0000000000400801 <+43>:    callq  0x400670 <_ZNSolsEi@plt>
   0x0000000000400806 <+48>:    mov    $0x400914,%esi
   0x000000000040080b <+53>:    mov    %rax,%rdi
---Type <return> to continue, or q <return> to quit---

Вот учебник: http://www.unknownroad.com/rtfm/gdbtut/gdbadvanced.html

objdump может перечислить содержимое, но я не думаю, что вы сможете взаимодействовать с вашим кодом так же, как если бы вы использовали отладчик.