Best Установить правила для локального компьютера в Ubuntu?

Правильно, так что это один из тех вопросов, который является как бы нюансным, но также и базовым, и поэтому его немного сложнее найти. Я хотел бы понять все это немного больше и убедиться, что рабочий контекст, который я имею, имеет немного больше смысла. (Я новичок в Linux в целом, и я использую Ubuntu для контекста -> Я предполагаю, что имеет значение для контекста).

(я тоже программист, так что теперь я немного понимаю архитектуру Linux (В ОЧЕНЬ ШИРОКОМ СМЫСЛЕ), но мне придется сравнить ее с вещами, которые я знаю, для контекста).

Так что правильно устанавливать новые программы? Как это делается хорошо, а не просто извлечение на месте, а установка в локальную папку, где я их когда-либо получил. Я также не имею в виду менеджер пакетов synaptic. В основном, когда я загружаю программное обеспечение, которое не поддерживается этим менеджером, как мне эффективно внедрить его в архитектуру и убедиться, что оно установлено правильно?

Таким образом, в контексте, это очень напоминает мне установку узлов для веб-сайтов, в основном я использую программу для настройки Express... затем добавляю важные библиотеки через NPM(что похоже на synaptic), затем добавляются пользовательские библиотеки с помощью перетаскивания.... затем добавив их в JASON в качестве ссылки, чтобы они запускались.

Basically, what is the equivalent of the 'recognized and added dependencies' where do I find that?

When I download the file and build the installer, do these files have a setup that will default into a install location? how would I know? And if not how do I go about changing it? And if this is not the case, what is the best location and practice to install in, and do I need to manually add the root of the file to the dependencies?

Basically, I've been spoilt rotten by windows EXEs that have managed that all for me, I need information and to be honest I don't even know where to BEGIN looking and tackling the problem.

Help a newb out?