Как заставить Pinta сохранять файлы.svg?

Pinta - это растровая программа редактирования, а не векторная программа, поэтому вы не можете сохранить ее в SVG.

Я не знаю, какие базовые библиотеки он использует, но если он не поддерживает сохранение в XPM, возможно, вам следует подать отчет об ошибке в исходной версии, заявив, что XPM не поддерживается.