Как я могу исключить все метаданные svn при синхронизации с унисон?

В вашем файле настроек:

ignore Name .svn

В командной строке: unison -ignore 'Name .svn',

Хотя немного странно синхронизировать svn checkouts. Обычно люди хранят отдельные проверки на отдельной машине и синхронизируются через репозиторий.

Вы можете исключить определенные файлы или каталоги, поместив строки "ignore" в свой файл конфигурации unison. Это должен быть ~/.unison/default.prf (или любой другой файл конфигурации для вашего конкретного профиля синхронизации).

[отредактировано только для того, чтобы поставить линии игнорирования, поскольку ответ Жиля лучше решил конкретный вопрос]

Я не проверял это сам, но согласно руководству, --ignore "*/.svn/*" вариант должен помочь.